常染色体缺失遗传咨询（二）2号染色体缺失

1.2p15p16.1缺失 区域内的缺失片段最大为6.9Mb，最小缺失是230kb。 首次发现于一名男性患者，有轻度畸形和智力异常。该区域有两个非常接近但又不同的关键区域，一个是2p15区域，有标记基因XPO1；一个 是2p16.1区域，有标记基因BCL11A。两个区域缺失导致的表型差别不大。BCL11A 的单倍剂量不足主要是对面部和语言发育产生某种特定影响。2pl5区域内的XPO1基因座与16p11.2染色质水平的物理性相互作用；这2个基因座不平衡个体的表型相似。如果缺失的范围大，表型会更严重, 可能会导致脑部结构异常；常伴有生殖器发育异常，OTX1 基因的丢失可能是关键。该缺失一般是新发变异。

2.2p21缺失 这种极为罕见的综合征只有纯合子状态时出现，表现为常染色体隐性遗传模式。该区域涉及的基因是PPM1B、 SLC3A1、PREPL 和 CAMKMT。SLC3A1 是该综合征中出现的胱氨酸尿症的基础；如果是较小片段的缺失，仅涉及SLC3A1和PREPL,会导致低张力-胱氨酸尿症综合征。这种综合征中也会出现癫痫发作、智力残疾及Prader-Willi综合征相似的面部畸形。

3.2q11.2缺失 该缺失大小为2.0Mb。缺失导致神经行为表型、面部轻微畸形及明显的身材矮小。这种缺失可以是新发变异，也可能遗传自父母一方。LM4N2L基因是一个标志性的位点。

4.2q13缺失 缺失大小为1.7Mb ，该处的缺失可能与智力缺陷、孤独症和畸形综合征有关，也可表型正常。在一些病例中，主要是心脏和颅面部畸形。BCL2L11、 FBLN7 和TMEM87b 基因的缺失可能是发病的主要机制。

这个缺失一般是遗传性的。携带者的父母可能显示或不显示任何迹象;这反映了基因组中其他位置变异的影响，很可能与“第二次打击“的 CNV相关。这种不完全外显在遗传咨询时，尤其要注意；对这种可能的二次打击的解释，也是一个更为现实的问题。对于该缺失及其他不完全外显的缺失或重复而言,将利于积累在不存在其他CNV情况下的外显率数据，以便与有特定CNV (或序列变体)时的外显率进行比较。

5.2q23.1缺失 是最常见的微缺失之一，导致的表型异常是一组综合征，染色体缺失的大小范围从约300kb-20Mb，但都有MBD5 基因的缺失。所有病例都是新发突变。临床表现与Angelman和Rett综合征相似，有严重精神发育迟滞、言语缺失、刻板的重复行为、小头畸形、共济失调和面容粗糙等特征，也有严重婴儿痉挛的报道。关键基因MBD5与其他缺失综合征相关的几种孤独症相关基因座之间可相互作用；这些综合征及基因包括Smith-Magenis 综合征中AR11、Pitt-Hopkins 综合征中的TCF4、Angelman 综合征中的UBE3A、Kleefstra 综合征中的 EHMT1 和 5ql4q21综合征中的MEF2C。因此，这些综合征中常见的神经行为表型是相似的。无论是MBD5 基因座内的缺失、重复或变异，都可能与神经发育障碍(MAND)相关。

6.2q24q31缺失 该区域中缺失片段最大为13Mb， 与上述条目和以下条目之间的缺失相似，或略有重叠。包括SCN1A 基因在内的一组SCN (钠通道)基因，可能是癫痫表型的致病原因。手指和脚趾的并指畸形，可能是由于HOXD基因剂量不足导致的。该缺失一般是新发突变。

7.2q31.1缺失 这是一种表现为可变的缺失综合征，缺失片段最大为7Mb。其内的HOXD 基因簇丢失是导致肢体畸形的原因（如大脚趾重复和指侧弯）。不同的畸形(在一些患者中有独特的面部形态，以及神经认知能力；从基本上正常到严重受损)可能与该缺失相关。可以是父母遗传给子女，也可是祖父母传递给孙子。

8.2q33.3q32.3 (del 2q33)缺失 该缺可以导致一种综合征；缺失片段的变化很大，从35kb-10.4Mb不等。导致的表型异常是多动症，并伴随有一系列的焦虑或攻击“快乐”表型;智力缺陷可能很严重；畸形并不严重，有时会类似马凡综合征的外观。SATB2可能是其重要的致病性基因；但在一些患者中该基因并没有发生缺失。该缺失一般为新发突变。

9.2q37.3q37.1缺失 是较常见的缺失综合征之一。该区域缺失导致的表型是一种Albright-样综合征。表型异常类似Albright遗传性骨营养不良 (身材矮小，掌骨较短)、特殊面容、智力缺陷伴有自闭症行为及肥胖等。该缺失片段大小有很大差异，一般为2.6~9.9Mb。该缺失遗传性的很罕见；也曾有过遗传性的报道。根据病例推测TWIST2和HDAC4基因缺失。可能是导致该表型的原因。

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